-Essentials est un must, il regroupe plein de commandes très utiles (Il me semble que les /warp sont inclus dedans):
http://forums.bukkit.org/threads/gen-sec-econ-tp-admn-essentials-v2-7-2-a-collection-of-useful-commands-1597-1791.15312/
-Voici une liste des commandes disponibles avec celui-ci :
http://wiki.n-serv.fr/minecraft/index.php/Minecraft:Plugin_Essentials
Après, pour les permissions, il me semble qu'il existe un plugin homonyme (permissions donc) mais que je n'utilise pas, alors je laisserais le soins à d'autres de te l'expliquer.
Et qu'entends tu par cuboider des constructions? Les protéger contre le grief?
Si oui, il me semble que c'est WorldGuard :
http://forums.bukkit.org/threads/sec-worldguard-5-3-block-fire-ice-melt-mushrooms-advanced-fast-area-protect-blacklist-1185.790/
Mais encore une fois, je ne l'utilise pas, donc je ne peux pas te le confirmer.
Voilà, en espérant t'avoir aidé ! 