Le souci, c'est qu'à l'endroit où tu as créé ton premier portail, il n'y a pas de place dans le Nether pour le construire, le jeu le déplace mais il doit se retrouver trop loin.
La solution, c'est de prendre les coordonnées de ton portail (x;y;z) et, dans le Nether, de créer un portail aux coordonnées (x/4;y;z/4)