Étrangement je l'ai trouvé plus facile que le 2, à quelques missions près (genre le 1er combat contre Bonaparte et les combats bonus des sources thermales).
Pour les missions bonus, je trouve qu'il y en a suffisamment (peut être pas au début cela dit). Entre les missions données au QG, les secrètes de certains personnages (Inaruna/Heine, Dino/Ashley...) et celles du Night Club, il y a de quoi faire.
De plus, Refi peut avoir un bon boost journalier de stat via la salle d'entrainement (Force, Def ou Magie) ou les bains (HP), même si ça bouffe un sablier à chaque fois.
Pour l'initiative, il faut bien gérer ses actions/déplacement pour avoir l'avantage sur les ennemis. De petits déplacement permet d'agir plus souvent.
Après, c'est vrai que le craft est bien chiant (surtout pour les armes ultimes).