Yop,
Ce que tu identifies comme une "transformation" d'un avion est en réalité un changement de skin/repaint. Pour faire tes propres peintures, je ne saurai comment te dire. Mais pour en ajouter des pré-faites à ta collection, il suffit souvent de copier-coller les textures en questions dans le dossier de l'avion correspondant dans le répertoire de Fsx.
Tu peux notamment aller sur Avsim.com pour en trouver. Section "File library", une inscription est requise.
Pour les compagnies aériennes virtuelles, je ne m'y suis jamais aventuré mais il me semble que cela peut être des compagnie créer de toute pièces par des utilisateurs (Noms, logo, type...) Donc... Plus comme des clans, en fait. A confirmer toutefois.