C'est normal, il y aura toujours une alarme, quelque soit la façon de désactiver le pilote automatique.
L'alarme sert juste à dire "attention, maintenant c'est vous qui pilotez". C'est surtout pour prévoir le cas où le pilote auto est désactivé contre la volonté du pilote : avec l'alarme, le pilote (le vrai) est au courant que s'il ne fait rien, l'avion ne sera plus piloté par personne.