Hello , j'ai effectivement u le même problème que vous et voici comment je l'ai résolu, j'ai éditer le fichier : InputTemplates.txt contenu dans le répertoire principal du jeu.
et j'ai dans ce fichier redistribué la fonction par défaut des boutons de mon pad 360 le plus simple étant d'inverser les L1 et L2 ainsi que R1 et R2 pas d'incidence dans le jeu même dans le tuto du début du jeu l'indication des touche correspond donc on s'y fais très bien.
pour ceux que ça pourra aider je vous joint mon fichier InputTemplates.txt .
1 telecharger ici: http://rapidshare.com/files/320497210/The_Saboteur.rar.html
2 décompresser celui ci (winrar)
3 copier/coller InputTemplates.txt dans le répertoire principale du jeu et écraser l'ancien (en prenant soin de le sauvegarder au préalable)
4 lancer le jeu et dans le menu de paramétrage des touches 360 réinitialisez par défaut et voila les boutons sont réatribué
ps : si vous reprenez une sauvegarde en cour après avoir lancé la save faite pause pendant le jeu et répéter "4"
voila j'espère avoir aidé