Bon je sais que ça fait tôt de parler de l'après ME3 alors que le jeu n'est pas encore sorti, mais il nous reste un mois et demi à attendre alors autant spéculer, même pour de l'inutile.
Alors je précise que je ne veux pas parler d'ici d'un ME4 ou autre, mais d'imaginer ce qui pourrait se passer DANS L'UNIVERS du jeu, en fonction de nos choix. Sachant qu'on aura forcément une fin (au moins) ou les Moissonneurs sont vaincus/détruits/repoussés/roustés et que cette fin devrait être canon pour laisser un avenir à la série que Bioware ne manquera sans doute pas d'exploiter s'ils ont un peu de logique, tant cet univers qu'ils ont créés le permet.
Après la probable alliance des races dans ME3 (j'ai refusé de lire les spoilers, il n'y aura peut être pas d'alliance, mais ça me parait peu probable), je pense pas que la Galaxie retrouve la paix, et que tout le monde vivra tout nu et main dans la main 
La Galaxie à feu et à sang, en pleine reconstruction pourrait être un théâtre facile de guerre civile. Plusieurs races, qui jugeraient leur action déterminante dans la guerre pourraient vouloir une plus grosse part du gâteau dans la reformation du conseil (Humains ? Turiens ?)
Les Krogans seront de retour en plus grand nombre, toujours avec leur nature violente, si on trouve un remède au génophage dans ME3. Une petite vengeance ?
Les Rachnis feront leur retour aussi, et ça pourrait poser problème à plus ou moins long terme.
Reprise des anciens conflits et intrigues : Geths/Quariens, Krogans/Galariens, Humains/Butariens (300 000 morts lors de la destruction d'un système par Shepard, les Butariens n'en resteront pas là).
Je vois aussi une grosse prise d'ampleur d'Eclipse et des Soleils Bleus aussi, dont la puissance pourrait largement soutenir la comparaison avec celle des armées conciliennes, au moins en partie détruites.
Vos avis/idées ?