Il y a les missions principales que l'on appelle Dossier (ou Case en anglais) et qui te donnent bien l'histoire du jeu. Tu n'accèdes à certaines qu'à une heure précise dans le jeu donc c'est dans ces moments là que tu fais les quêtes secondaires, que tu sauves les survivants, etc...
Il est possible de faire toutes les quêtes principales, secondaires et de sauver tous les survivants, mais c'est assez difficile à faire surtout dans une première partie.
Les heures continuent même quand on ne fait pas les missions oui, c'est pour cela que gérer son temps est très important dans ce jeu.
Si tu rates une mission principale toutes les autres sont annulées et tu te retrouves avec la plus mauvaise fin, c'est pour cela qu'elles sont à faire en priorité. Si tu rate ta quête principale tu restes à faire les quêtes secondaires jusqu'à ce que le temps arrive à 0.