Ah je viens de comprendre.
En faite, c'est quand t'installe manuellement un mod, il a, souvent, un .esp ou un .esm que tu met dans le fichier Data, et des trucs genre Texture ou Meshes etc ...
Et de base, quand tu fais ca, seul le .esp est reconnu par Skyrim.
Le Load Loose Files permet de "dire" au Launcher : "fais fonctionner les fichiers autres que l'.esp"
C'est donc une chose à coché que pour les mods installés manuellement, et encore pas tout.