Pour ceux pour qui l'astuce avec skyrimpref ne marche pas, je viens de trouver une autre solution. Il faut télécharger et installer le Nexus mode manager, puis aller dans le répertoire du jeu. La, il devrait y avoir deux .exe : TESV.exe et SkyrimLauncher.exe. Coupez et coller SkyrimLauncher.exe dans un autre dossier, puis renommez TESV.exe en SkyrimLauncher.exe.
Ouvrez le nexus mod manager, selectionnez vos plugin puis lancez skyrim via le nexus mod manager. Normalement ça marche.
Ps : j'ai aussi ajouté les 2 lignes
[Launcher]
bEnableFileSelection=1
dans skyrimprefs.ini (mesdocuments/mygames/skyrim), je pense que ça a son importance.