MO est capable de reconnaître les esp et esm déjà installés. En revanche, si tu as déjà mis des textures, il ne les verra pas.
Il possède aussi une option pour importer ta liste de mods NMM vers lui. Cependant, j'ai jamais testé cette option, quand je suis passé à MO, j'ai refais une installation propre de Skyrim et de tous mes mods pour être sûr d'avoir un jeu stable et beau.