Un des trucs important pour les mods : SkSE
SkSE est un launcher secondaire qu'on installe.
Il permet de faire fonctionner pas mal de mods.
Un autre important : SkyUI
Il change le menu des objets pour quelque chose de plus propre, ainsi que d'autres trucs.
N'hésite pas a bouffer le NMM (Nexus Mod Manager)
Il te permet d'installer/désinstaller simplement les mods, il est juste un peu chaud a comprendre au début 
Les mods sur la confrérie des traducteurs ne fonctionnent pas souvent avec NMM, faut les installer manuellement.
Installe les mods un par un, comme ça :
Installe un Mod => Lance Skyrim => Si le jeu ne crash pas au main menu, quitte le jeu. => Installe un Mod => Lance Skyrim => etc.
ça te permet d'éviter de devoir chercher quel mod est incompatible avec un autre, ça peut devenir problématique si tu en installe une dizaine, ou une vingtaine.
Pour installer manuellement un mod :
Si c'est un dossier Data => Tu prend le fichier, et tu le fusionne avec le fichier Data présent dans Steam/SteamApps/common/Skyrim
Si c'est des fichiers .esp ou .bsa par exemple => Tu prend ça et tu met dans le fichier Data
Si c'est des dossiers genre textures, music, sound... => Tu prend et tu met dans le fichier Data
N'hésite pas a lire un readme avant d'installer un mod
Les liens utiles :
SkSE => http://skse.silverlock.org/
SkyUI => http://www.nexusmods.com/skyrim/mods/3863/
Nexus, un site avec plein de mods => http://www.nexusmods.com/skyrim/ (en anglais, généralement)
Confrérie des traducteurs => http://www.confrerie-des-traducteurs.fr/skyrim/index.php (Un site avec que des mods traduits en français)