Ce que tu peux faire c'est désinstaller Skyrim via le panneau de configuration (tu garderas tes saves, et les mods seront toujours présents dans le dossier Data). Après je te conseille de supprimer ce qui reste dans le répertoire de Skyrim (à part les screens, tu peux les garder eux). Et ensuite le réinstallé normalement via steam. Une fois Skyrim installé, si tu peux faire une copie de ton dossier skyrim "propre" sur disque dur externe ou bien sur un autre disque dur dans ton ordinateur, que tu n'utilisera pas. Il servira juste au cas où tu as un autre soucis.
Et si jamais tu dois re désinstaller skyrim, refais-le le via le panneau de config, sauf que maintenant tu copie et tu colle ton dossier skyrim "propre" dans Steam/SteamApps/Common. Et ensuite à partir de maintenant tu peux "installer" skyrim sur skype (ça prendra 2-3 minutes le temps de remettre quelques fichiers). Et voilà !
Ça c'est pour "comment supprimer le plus efficacement un jeu sur steam".
Pour le DLC j'en ai aucune idée.. Désolé