Fais comme ils disent. Je préfère installer les mods manuellement, ça permet de se souvenir d'où les fichiers sont si je veux les supprimer/modifier.
En général, quand tu dl un mod, tu peux trouver un fichier readme qui t'explique comment l'installer. Où souvent c'est carrément écrit sur la page de description du mod.
Quand tu lances le jeu et que le launcher s'affiche, va vérifier que les .esp des mods sont bien cochés dans la liste de chargement.