Salut,
Le plus simple avec MotionInJoy et les jeux sur PC, c'est de toujours te mettre en émulation controller Xbox 360.
C'est le mieux car certains jeux sont exclusivement jouable avec une manette de 360...
Donc tu connectes ta manette (bluetooth ou filaire), tu lances "DS3_Tools", tu sélectionnes l'émulateur controller 360, puis sur le bouton "Utiliser" un peu plus bas ...
Pour ce qui est de redéfinir tes touches, passe toujours par le jeux, ça t'évitera bien des prises de têtes ...