Dans le 2, les améliorations se traduisent principalement par l'augmentation des dégâts, de la précision... et se font par le biais du laboratoire du Normandy.
A noter qu'il faut avoir recruté le scientifique galarien pour y avoir accès, et que ces améliorations s'achètent non pas avec des crédits, mais avec des ressources récupérées au gré des niveaux ou plus généralement en scannant les différentes planètes. Ca nécessite néanmoins des sondes qui, elles, s'achètent dans les "stations services" spatiales qu'on trouve un peu partout.
Pour ce qui est des mods d'armes, ici, on en a, mais ça se fait via les capacités des personnages, et ça se limite au type des munitions (incendiaires, cryo, perforantes, anti-grav...). L'apparence physiques n'est pas modifiable (mais on a un choix d'arme assez varié tout en restant dans des quantités raisonnables). Seule l'armure peut être personnalisée.