J´y connais pas grand chose, mais pour le peu que je sais, je vais te répondre... le HDL (3.6.1 en l´occurence) est beaucoup mieux que le HDA.
Pourquoi? Et bien parce que le dernier HDL est par exemple patché GOW II, il permet également de faire tourner beaucoup d´autres jeux qui ne passent pas avec le HDA. Niveau compatibilité, le HDL est beaucoup mieux (plus souvent mis à jour aussi).
Tu peux toujours garder le HDA, il te servira à installer la faille PS1 sur ton HDD (cas ou ton swap te lache, cas ou t´es obligé de tout formater etc...). Inutile de le jeter, ça peut toujours servir, on sait jamais 