Les comparer a peu, voire pas de sens, tout ce qu'ils ont de commun, c'est le moteur graphique.
D'un côté tu as FFIII, un jeu au tour par tour des plus classiques, avec un scénario minimaliste et une facilité assez décevante (sur DS et Idevice), mais qui possède malgré tout un charme indéniable. Son grand atout par rapport au IV réside dans le système de jobs hérité de FFI, et qui sera encore amélioré dans FFV.
De l'autre côté, FFIV possède un système de combat plus dynamique, un scénario plus profond et des personnages beaucoup plus charismatiques que dans FFIII ( même avec un nom et une personnalité, les persos de FFIII sont aussi inexistants que sur NES). Le jeu DS bénéficie d'un système de compétences à distribuer pour contrebalancer l'absence de réel système de jobs, et d'une difficulté un peu plus relevée, même si ça casse toujours pas des barreaux (les combats sont un peu plus techniques).
Mais bon, à choisir, je préfère la version GBA de FFIV, ou mieux, la version PSP.