Le saumon peut être affecté par des maladies (surtout depuis la fin des années 1980), telle la vibriose des eaux froides. Ces maladies sont traitées par des antibiotiques, la consommation de ceux-ci a baissé de 96 % en 10 ans, au cours d?une année, 1 saumon sur 200 en prend, contrairement à 1 bovin sur 5 ou à 1 Norvégien sur 2.