Le 2, c'est un passage retiré du 1 pour y jouer indépendamment. Ça passe, parce que l'histoire du 2 n'est liée au 1 que par le fond. Ça couvre des événements en marge.
Dans le 3, ce passage est réintégré à l'histoire du 1 pour en garder la continuité, même si ça fait une parenthèse un peu spéciale, mais pas moins captivante.
En plus de ça, dans le 3, tous les petits plus de précommande du 1 sont inclus (de façon plus subtile il me semble), et les maps réservées aux boss fights sont remaniées pour offrir plus d'options (pas hyper utile à mes yeux, ça mériterait presque un "yet another director's cut").
Pour finir, ils ont ajouté un New Game +, si je me souviens bien.
Il me semble que les 1 et 2 n'existent même plus dans Steam, et que seule la 3 reste disponible, ce qui me parait logique.