Tu as le choix lors de certaines missions. Et pour les missions neutres, c'est ta façon de la faire qui déterminera si tu as été gentil ou méchant (tuer des civils, tuer/capturer les ennemis,...)
Pour les actions, tu peux faire moitié gentil, moitié méchant si tu veux. Tu n'es pas obligé de choisir un côté, c'est juste que pour devenir infâme ou héros, c'est un cumulatif assez conséquent de mauvaises ou bonnes actions. En gros, ça prend beaucoup de temps pour devenir totalement mauvais ou bon, donc faut pas non plus trop souvent faire un côté ou de l'autre si tu veux arriver à l'opposé d'un côté.