Dr.Eggman a construit Shadow, un dark Sonic dans le but de se battre contre Sonic qui passe son temps à faire rater ses complots. Sonic se battra donc contre Shadow, chaque perso aura un adversaire bien précis: Dr.Eggman et Tails s´affronteront deans des machines (!) alors que Knuckles et Rouge (une nana) se disputeront des morceuaux de cristal répandus dans les niveaux. Les personnages se rencontreront de temps en temps et devront soit s´affronter, soit s´aider, les objets en cause seront les émeraudes du Chaos une fois de plus...
Au début du jeu, Sonic doit échappé à GUN, une société qui semble vouloir le capturer. Il prend la fuite dans San Francisco mais ne sait pas que Shadow s´y trouve également et qu´il aurait lui aussi des ennuis. Tails quant à lui est détenu dans une prison et la première chose à faire sera de s´en échapper.
Bref, c´est encore assez flou dans le scenario ! La Sonic Team travaille actuellement sur les angles de caméra...
