Déja faisons le point sur ce qu´on sait sur l´hisoire ainsi que le contexte historique :
Metal Gear Portable Ops se déroule en 1970, 6 ans aprés les événements de Snake Eater. On est toujours en pleine guerre froide entre l´Est et l´Ouest, Les Etats-Unis sont empétrés dans la guerre du Vietnam, la page la plus noire de son histoire. Richard Nixon a remplacé Lyndon.B Johnson depuis 1969, il restera en place jusqu´à sa demission en 1974 aprés le scandale du Watergate. Le dircteur de la CIA n´est plus John Alex McCone, (Dans MGS3,le vieux à qui Big Boss refuse de serrer la main et celui qui discute avec Ocelot aprés le générique), mais Richard Helms, c´est le nouveau patron d´Ocelot.Les Philosophes Américians Sont en possesion de la moitié de l´héritage mais il leur faut l´autre moitié qui est au main du KGB, pour créer les Patriots.
Du coté de l´Est, L´URSS est toujours en conflit avec les Etats-Unis mais sans jamais y venir au armes. Le KGB posséde la moitié de l´héritage, Ocelot travaille pour le KGB mais aussi pour la CIA. Khrouchtchev a abondonné le pouvoir et c´est Brejnev qui est au commande de L´URSS, celui-ci était autrefois soutenu par Volgin et le GRU.
Durant les années 70, l´amérique du sud est une zone instable à cause des nombreux coups états, organisé ou non par la CIA. Au Chili par exemple, en 1970 Salvador Allende est élu président, il est Socialiste et contre les américains, il cherche a nationaliser les entreprises ce qui va contre l´intérêt des USA. 3 ans plus tard, Allende est renversé, Augusto Pinochet arrive au pouvoir. On ne sait toujours pas si la CIA est à l´origine de ce renversement.
C´est dans ce contexte que débute MGS PO.
L´unité Fox est une branche de la CIA chargé de remplir des missons spéciales dans le monde, cette unité est sous le commandement du Major Zero, Sigint et Para-Medic sont toujours membres.
On apprend qu´en Amérique du sud, un nouveau prototype du Shagohod est mis au point, il est capable de lancer un missible nucléaire sur n´importe quelle région du globe. Subitement, L´unité Fox vole des ogives nucléaires à la CIA et prenne d´assaut la base militaire ou est entreposé "l´ultime arme", il menace de lancer un missile sur l´URSS. Le Major Zero est alors emprisonné car il est accusé d´être le cerveau de l´opération. Big Boss est aussi emprisonné bien qu´il ait quitter l´unité Fox depuis un momment. Big Boss est chargé d´éliminer les membres de l´unité Fox et de détruire le prototype du Shagohod si il veut être innocenté.