Ce qu'on sait concernant Mission Hydre c'est que Cabaal à manipulé à la fois le GDI et le NOD pour récupérer la partie manquante du Tacitus, le même Tacitus sur lequel Kane s'est basé pour mener ses expériences avec le Tibérium. Il ne faut pas oublier que Kane a découvert le Tacitus dans un vaisseau extraterrestre (visible dans l'avant dernière mission de Renegade - y entrer constitue un objetctif bonus).
Tratos et Cabaal étaient les seules personnes à pouvoir décrypter le Tacitus incomplet. Avec Tratos mort (comme ordonné par Cabaal si mes souvenirs sont bons), Cabaal a été pendant un temps le seul à avoir libre accès à toutes les données y étant contenues.
Comme dit par le Dr Boudreau dans la dernière vidéo GDI de Mission Hydre, le Tacitus contient des "millions de teraquad de données".
Ce qu'on voit dans la dernière vidéo du Nod dans Mission Hydre décrit parfaitement Cabal : une IA reliée à des composants humains - des cerveaux, pour augmenter considérablement sa puissance.
On sait aussi que Kane a commencé à concevoir Cabal vers la fin de la Première Guerre du Tiberium (on peux l'entendre parfois lors de la dernière mission de Renegade). Etant donné qu'une IA fortement boostée va plus vite dans le traitement des données, il est fort probable qu'il ai trouvé dans toutes les données du Tacitus de quoi fabriquer une arme assez efficace : le Core Defender, doté d'un blindage à base de Tiberium (responsable de sa forte resistance aux dégats, de sa résistance aux EMP et accessoirement de sa couleur).
Concernant la dernière image de Kane dans une cuve reliée à Cabal, on peut penser qu'il a été intégré à son réseau de cerveaux, mais étant donné qu'on voit l'image et la voix fluctuer entre celles de Cabal et de Kane, il est possible que la conscience de Kane ne se soit pas laissée utiliser par Cabal et qu'ils se soient "battus" pour le contrôle du corps. Dans tous les cas je ne pense pas qu'il y ai eu un vainqueur franc, mais plutôt un exaequo car comme Cabal le duit lui même : "Nos directives doivent être révisées". En utilisant le "nous", ça prouve que soit Kane a réussi à transmettre des ordres à Cabal (soigner son corps), soit Cabal et Kane ont fusionné.
Etant donné le manque flagrant d'informations concernant la période entre Mission Hydre et Tiberium Wars, on ne peut que spéculer.
Une chose est sûre : Cabal n'a pas été détruit comme montré dans la dernière mission (la dernière vidéo du NOD le prouve). Même si il est dit dans la base de données de Tiberium Wars que le dernier bunker de Cabal a été détruit en 2043 (le GDI a même organisé une cérémonie pour l'occasion ...), je doute que le dit bunker ait été le dernier.
Concernant le souci des fins de CnC, on sait qu'on la fin de Soleil de Tiberium la Terre est encore la Terre et que la station Philadelphia est encore en orbite, donc c'est la fin coté GDI qui est prise.
Concernant Mission Hydre c'est encore plus simple, étant donné que les deux campagnes du NOD et du GDI racontent la même chose : la trahison de Cabal, l'alliance, et pour finir la destruction de Cabal. Pour ce qui est de CnC1 je ne peux rien dire, je ne l'ai jamais eu entre les mains ^^