Bon... je saurais pas vraiment quoi dire vu que je n´ai jamais eu de problème avec 2142 sur Vista sauf des retours sur windows
Bon.. Installe tu les mises à jour de windows
As tu installé le Hotfix de nvidia pour Vista
Si c´est non.. Par ici 
http://www.nvidia.fr/object/windows_vista_hotfixes_fr.html
Si Oui... Vérifie bien qu´il n´y a aucun programme (antivirus ou un autre programme du genre) qui bosse pendant le jeu...
Et sinon, Si cela peut te rassurer. J´ai aussi remarqué (pas certainement dans les jeux) que mon Disque Dur gratte bêtement sans raison
Mais sinon, cela peut être aussi le fait que ton DD est endommagé 