Les Etats pontificaux ne sont destructibles que si il n'y a plus de pays pour choisir le pape (donc il faut détruire toutes les nations catholiques et ne pas l'être soi-même).
Quant à la ville au Sud-Ouest de la map, comme elle est super loin de tout, les hommes que tu y envoie ont de très grandes chances de se rebeller, donc je te conseille d'y envoyer beaucoup d'hommes et en plusieurs armées, si c'est bien ça le problème. 