Ok je vais repondre a tes premiere question plus en details.
SubZero : Dans le 1 il est en principe present pour assassiner Shang Tsung mais tombe sur Scorpion qu´il a tuer auparavant et qui veut donc se venger. En principe Scorpion tue SubZero tout simplement. On supose que dans l´intro de MK ShaoLin Monk il s´agie du frere puisqu´il reste bien en vie et plus tard dans la story recois la balafre. Une fois mort Original Subzero devien Noob Saibot, mais bon celle la elle a été sortie de MK Deception, a la base Noob etait juste un perso de l´ombre, du clan Brother of Shadow, le clan de Shinnok et Quan Chi dans MK4/Mythology SubZero.
Sindel : Effectivement Khan l´a utilisé pour envahir la terre, une fois le tout finis Kitana a briser le sort et sa mere redevien libre, seul bemol elle garde son look de sorciere alors que normalement s etait un look pour mechante...je trouve sa un peu con mais bon...
Jade : Elle obeissais a Sindel, donc vu que cette derniere etait mechante...on va dire qu´elle n´avais pas trop le choix en somme. Mais elle a toujours ete la meilleur ami de kitana et donc quand sindel revien bonne elle est plus que contente.
Cyrax : Ces un cyber ninja du lin kuei programer pour tuer subzero dans le 3, mais il echoue et se retrouve coincer dans le desert(le meme que MKD qui est une arena "nostalgie") d´ailleur dans le 3 ultimate on vois Cyrax dans le background pris dans le sable. Il se fais trouve par les special force et reprogramer du cote du bien, puis durant le 4 il retrouve des flash back de sa vie d´humain et se fais donc une sorte d´operation qui fais qu´il redevien partietellement humain(au moin la concience) et boss donc pour les Special Force.
Scorpion est neutre car il veut simplement vengeance tout dabord contre subzero puis contre quan chi, mais a partir de MKD il devien le champion des elder gods suposement et ces pas trop clair ce qui arrive apres...
Sheeva : Elle boss pour Khan, en principe ces Motaro qui la tue, si tout les perso n´aurais pas revenu dans Armageddon, elle serais reste morte tout comme Hsu Hao, donc pour le moment on presume qu´elle est bien morte etant donner ya pas d´histoire dans MKA
Kabal : A la base il se fais massacrer par un commando d´Extermination de Shao Khan dans le 3, donc est en somme un bon puisque il en veut a Khan. Mais s´etait tout de meme un black dragon avant donc un criminel alors il n´est pas vraiment bon si on peut dire, alors khan disparu (en principe) a partir du 3 kabal reprend ces activite criminel.
Un dernier point: quels sont les persos ayant changé d´alignement au cours des différents MK :
Oula...hum je dirais Cyrax mauvais vers bon, SubZero qui etait en principe un criminel(vu que son clan etait un clan d´assasin) devien maintenant bon, Sindel de mechante a bonne, Ashrah etait a la base un demon du nether mais devien pur en tuant les autres demon, Sareena se tourne contre Quan Chi et aide subzero donc elle devien bonne.
Voila de memoire ces a peu pres sa.