CHKDSK n´a rien a voir avec la defragmentation. Il s´agit d´un utilitaire de diagnostique de disques, ton reboot a peut être altéré la table d´allocation ou des secteurs et/ou données du disque.
si tu es sous win xp fais démarrer>éxécuter>cmd
danas l´invite de commande tape chkdsk C: (ou d: ça dépend où s´est installé)
Par contre je comprend pas un truc, tu me dis que tu relances l´install? A partir d´un cd-rom ou d´un client téléchargé?
Sinon vire complétement le rép. guild wars de ton disque dur et recommence