Certaine ont des incidences. Par exemple, selon les réponse donnés vis-a-vis de ta soeur, elle viendra (ou pas) te voir dans ta chambre à Luna. Si elle ne vient pas, alors tu n´auras pas les 2 choix de fin si tu reuni les 108 mais seullement 1.
Aprés, il y´en à peut-être quelques autres, par exemple tu peux acepté la proposition du Baron pour avoir une fin rapide et minable ^^.
Ou alors certain choix de bataille plus tard dans le jeu (notament le choix de defendre ou non son QG qui as de grosse repercution).
Mais la plupart ne semble pas trés importante. Celle de reflexe sur le combat de Zegai permettre de le recruté plus facilement celui-ci plus tard (pas sur quand même)