Tes deux partitions utilisent le même systeme de fichier ? (HFS, FAT.. )
Y'a deux methodes, la propre un peu chiante : sauvegarder tes données, reformater en une seule (tout effacer), et reinstaller puis remettre tes données.
Ma methode un peu moins propre conciste à démarrer sur le DVD d'installe et à fusionner tes deux partitions en une seule, mais il serait préférable qu'une des deux soit vide, et surtout qu'elles n'aient pas été trop sollicités..ou alors defragmentes les avant avec un logiciels adequat.
quoi qu'il en soit avant toute opération penses à bien sauvegardé l'intégralité de tes données importantes.