ffmpeg peut le faire, mais pas avec tous les formats de sortie
j´avais essayé xvid et divx, ça marche pour les 2 si on prends la version mencoder, la version ffmpeg ne marche pas.
il me semble aussi qu´il faut faire attention à la taille (pixels), si je me souviens bien ffmpeg prends automatiquement un pixel de moins avec certains réglages, et ça foire.