La solution pour moi fut très simple : la version des mods.
Je jouais en multi avec mon pote et ça désynchronisait au bout de quelques minutes. Je me suis rendu compte à l'époque que j'avais la version 2.4 de l'IA Sorian et que mon pote lui avait la 2.5 ! Résultat l'ia agissait chez lui d'une manière différente que chez moi : donc le jeu se désynchronisait.
Vérifiez bien la version des mods que vous installez. C'est à mon sens la solution car une fois les mods mis à jour pour les deux : plus de désynchro.
Enjoy.