Les 2 expressions sont correctes mais ne veulent pas dire la même chose
"Autant pour moi" veut dire "de même pour moi, pareil pour moi"
et Au temps pour moi veux dire que l´on s´est trompé
exemple :
LE GARÇON DE CAFE — Pour Monsieur ?
PREMIER CLIENT — Un demi.
LE GARÇON — Et pour Monsieur ?
SECOND CLIENT — Autant pour moi [un demi]... Euh... Au temps pour moi ! Un café.
source : volvic
non sérieux 
http://www.mon-expression.info/index.php/autant-pour-moi