1) Non, c'est même indiqué au moment de lancer le transfert.
2) Absolument, les versions G4 sont toutes quasi-totalement compatibles.
3) T'as le message "La pile interne est épuisée" au démarrage ?
Si oui, tu peux suivre ce tuto, à condition que tu aies le matos nécessaire.
http://shinyshunters.fr-bb.com/t5249-tutoriel-changer-la-pile-interne-des-versions-rubis-saphir-et-emeraude
Celui-là est un peu bourrin et trop système D à mon goût, sinon, il y a celui-là, un peu plus académique, mais en anglais :
http://www.overclock.net/t/465536/tutorial-replace-internal-battery-for-pokemon-ruby-sapphire-emerald
Si c'est pas le cas, il te suffit de relier ta cartouche à Emeraude, Vert Feuille, Rouge Feu ou les jeux Gamecube