Oui, tu aura les 30 jours gratuit.
Steam te sert juste a télécharger le jeu et a le "stocker" sur ton compte Steam.
Mais tout ce qui concerne ton compte Star Trek Online (comme pour son activation), sa se passe sur le site du jeu http://www.startrekonline.com donc pour les carte prépayé tu pourra les utilisé sans problème, puisque c'est sur le site http://www.startrekonline.com que tu devra entré ton code.