En mettant à jour, ton iPod se restaure d'abord, c-a-d qu'il se met au firmware d'origine de celui que t'avais. Donc il supprime toutes les données, et après il se met à jour.
Pour l'éviter, tu dois avec un iPod jailbroken et prendre PkgBackup pour les appli cydia. Mais pour les sauvegardes je sais pas...
Tu peux aussi faire restaurer a partir d'une sauvegarde précédente à la fin d'un MAJ, mais je sais pas si tu récupèreras tes sauvegardes 