Non, ça dépend. Si tu vas sur une rom qui est basée sur stock, c'est à dire qui correspond à la rom d'origine mais customisé, tu ne perds rien sauf si tu le décides. Après, ce que tu risques c'est d'avoir des apps qui crashent et d'autres problèmes du genre, c'est pour ça que souvent on fait un wipe(supprimme les données).
Par contre, si tu veux flasher une rom basé AOSP, il faudra faire un wipe obligatoire sinon ça marchera pas. Pareil dans le sens inverse (AOSP vers Samsung)