Le root ne comporte aucun risque, et ça n'annule pas la garantie.
En ce qui concerne le déverrouillage du bootloader, officiellement cela annule la garantie, cela dit, si vous rencontrez un problème qui n'a rien à voir avec le déverrouillage du bootloader (par exemple un problème avec un bouton physique du mobile), la plupart des marques prendront tout de même le téléphone en garantie (HTC le fait, par exemple).