Il n´y a pas moyen de désinstaller Windows ´proprement´, donc formate simplement la partition sur laquelle tu as installé Windows 2000, je ne vois pas où est le problème
Sinon tu supprimes le dossier Windows de la partition contenant Windows 2000, tu ouvres le boot.ini présent sur la partition sur laquelle XP est installé et tu le modifies en conséquence. Si tu ne vois pas de quoi je parle, utilise la première solution c´est plus sûr 