Évidemment, tu ne peux pas formater ta partition système...
C'est comme si tu sciais la branche sur laquelle tu es assis.
J'avais mal compris ton probleme, dans ce cas ta solution serait de débrancher ton disque C: (ou de changer l'ordre des disques dans le bios), ensuite tu installes ton système sur ton nouveau disque, et a partir de là tu pourras formater l'autre.