Quand tu lance le formatage y'a des options. Tu sélectionnes NTFS.
Sinon win7 peut s'installer sur du FAT32 normalement, donc je sais pas ce que t'as comme support d'install mais... y'a un soucis qqpart.
http://www.toutwindows.com/win7_install.shtml
"option de lecteur (avancées)" pour accéder a l'utilitaire de formatage