Voila mes 3 favoris:
Paint.Net (gère calque, transparence, a jour, simple, avec déjà pas mal d'effets applicables il gère de plus l'ajout de plugin, ...)
Photofiltre version gratuite (bien qu'ayant pas mal de filtre, il a des lacunes pour la gestion de la transparence des .png , et n'a pas été mis à jour depuis très longtemp (et ne le sera probablement plus, ...)
The Gimp (beaucoup d'option, mais l'interface n'est pas facile à prendre en main, et il est plus complexe).