Tu es sous XP ou Vista?
Si c'est sous XP, j'ai déjà été confronté à ce genre de problème.
par contre, si c'est long, laisse le faire, tu verra, le miens il démarrait au bout de 2~3 minutes.
C'est seulement après une petite restauraton que ma bécane repartait l'air de rien. Je n'ai jamais eu ce problème sous W2ooo ou Vista!
Au passage, vérifié bien que tu n'ai pas de disque dans tes lecteurs CD, vierges ou pas. A l'époque, j'avais remarqué qu'un CD vierge ralentissait le démarrage de l'ordi.