Quand je me lance dans une désinfection, je fais un nettoyage complet jusqu'à qu'il n'y ai plus de trace d'infection. Au pire, s'il reste une clé de registre (par exemple), ça peut arriver, ce n'est pas grave puisque l'infection sera inactive.
Si t'es paranoïa à ce point, ne viens même plus sur le net.
Il y a des gens qui ont beaucoup de données sur leur PC. Je ne sais pas vous, mais moi j'y passerai ma journée à reformater ... Ce n'est pas une manière de faire.
Tu ferais mieux de leur conseiller d'utiliser des images systèmes ...
D'ailleurs on se demande où tu les choppe ces infections, hein 
Vous devriez plutôt, dès le début, trouver des méthodes pour mieux sécuriser votre PC. Utiliser un compte limité sera déjà une très bonne chose.