C´est s´exposer à une belle merde, l´un et l´autre ayant accès à la totalité du disque dur, ils pourraient fort bien se voir l´un l´autre comme des éléments potentiellement dangereux 
(c´est du vécu)
Cela dit, il y a nombre d´antivirus qui cohabitent très bien aussi, hein, ne te mets pas martelle en tête avec mes conneries
Cela dit, un bon antivirus suffit amplemant (particulièrement si tu as un bon firewall 