virtualdubmod accepte le mpeg2
pour la découpe, tu peux utiliser via un script avisynth la fonction trim qui dit précisément de quelle image à quelle image tu désires traiter la video ( si par exemple la video contient 25 images par seconde comme le pal, alors la précision se fera à 40 millisecondes près ), mais faudra aussi traiter le son...
sinon tu as mpeg2cut ( basé sur dgindex ) qui découpe gratuitement les mpeg2