Plusieurs autres licences du jeu vidéo contiennent d'amusants clins d'œil liés à la série. Ainsi, dans Metal Gear Solid 4 et Prince of Persia, il est possible d'acquérir la tenue d'Altaïr, tandis qu'un succès de GTA 4 se nomme « Assassin's Greed ». Enfin, des figurines des Lapins Crétins revêtant la tenue d'Altaïr ont également été proposées lors de la sortie du jeu Rayman Prod' présente : The Lapins Crétins Show.

Mais la série Assassin's Creed elle-même a de nombreuses références. Ainsi, plusieurs succès et répliques renvoient à Mario (succès « Plombier », la réplique « It's me, Mario »...), et de nombreux clins d'œil sont faits à Metal Gear Solid (la tenue de Raiden, une boîte en carton du jeu...) et d'autres easter eggs en tout genre viennent encore se greffer à la saga. On peut citer la pieuvre qui apparaît dans un tombeau du deuxième opus ou encore les dialogues entre Ezio et Machiavel, qui s'en serait alors inspiré pour écrire « Le Prince » (Il Principe est d'ailleurs l'un des succès de Brotherhood).