Notre héros est malgré lui forcé de rester dans la ville durant toute l'aventure. Alessa se sert de lui grâce à ses pouvoirs et en fait un valet dont la tâche sera d'assembler les différentes pièces du Flauros. Il s'agit en fait d'un artefact possédé par la secte dont fait partie Dahlia, qui serait assez puissant pour contenir un dieu (même si le mystère demeure sur cet objet, on devine que la naissance de Cheryl de Silent Hill 1 y est liée). Accomplissant sa tâche aveuglément, Travis enquête sur les membres de la mystérieuse secte, ainsi que sur le docteur Kaufmann et Dahlia Gillespie. Durant ses recherches dans la ville, il vit un terrible tourment. Tantôt il est attaqué par d'ignobles créatures, tantôt il revit son horrible passé. Petit à petit, il est amené à accepter ses actes. Traumatisé par la négligence de ses parents durant son enfance, Travis a en effet causé leur mort. Il a même assassiné plusieurs individus suite à cet incident, avec un modus operandi récurrent. Grâce à l'appel d'Alessa, sa venue à Silent Hill lui a permis de pardonner ses propres fautes et de vaincre le traumatisme de son enfance. Selon la « bonne » fin, Travis reconstitue le Flauros et quitte Silent Hill serein, en laissant Alessa et Cheryl.