Le terme de Sannin signifie littéralement "les trois individus". C'est le nom donné au trio légendaire qui fut entraîné par Sandaime, le troisième Hokage.

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Jiraiya

Aussi invraisemblable que ça puisse paraître, l'ermite des crapauds est bien l'un des trois ninjas de la légende. Il prend le relais de Kakashi après avoir malencontreusement mis KO maître Ebisu qui devait se charger de la formation de Naruto. En réalité, Naruto lui rappelle le quatrième Hokage et il perçoit l'énorme potentiel caché à l'intérieur de ce gamin exaspérant. Surnommé "l'ermite pervers" (ero sennin), Jiraiya est un jônin lubrique et exubérant qui se croit sur une scène de kabuki. Ce pervers assumé n'est autre que l'auteur du Paradis du Batifolage, le livre de chevet de Kakashi. Jiraiya est d'ailleurs un professeur peu recommandable qui profite de la motivation de Naruto pour parvenir à ses fins, quitte à lui voler son argent sous prétexte de le mettre sous bonne garde.

C'est pourtant l'un des trois légendaires Sannin et il mérite amplement sa réputation. Il apprend à Naruto l'art de dissocier les deux types de chakra qui sont en lui pour libérer le pouvoir du démon-renard à neuf queues sans aller au-delà de la quatrième queue, ce qui a bien failli lui coûter la vie. Il a également failli mourir jadis de la main de Tsunade pour avoir tenté de regarder du côté des femmes dans une station thermale.

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Ayant fait un pacte avec Gama Bunta, le crapaud géant fumeur de pipe et maniant un sabre, il peut désormais l'invoquer n'importe quand et recourir à des techniques combinées, telles que l'embrasement de l'huile (Gama Yuendan) où Jiraiya utilise Katon pour enflammer l'huile que recrache Gama. Il peut aussi piéger son adversaire dans l'estomac du crapaud (Gamaguchi Shibari) en l'entourant de murs de chair qui se referment inexorablement sur lui. Avec le gardien d'aiguilles (Hari Jizô), il dresse ses cheveux autour de son corps comme une armure constituée de lames aussi pointues que des aiguilles. Jiraiya nous réserve encore pas mal de surprises puisque les tous derniers chapitres parus nous le révèlent en "mode ermite".

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Tsunade

Unique élément féminin du trio légendaire, Tsunade est la petite-fille de Shodaime qui lui a légué son précieux pendentif. Elle est spécialiste des traitements médicaux et connaît l'art de guérir par les sangsues. Souhaitant mener sa vie comme elle l'entend, elle ne réside pas à Konoha et fait tout pour que personne ne sache où la trouver. Sa passion immodérée pour les jeux d'argent et de hasard la pousse à jouer plus que de raison alors qu'elle perd quasiment tout le temps. Pour elle qui porte l'idéogramme du jeu sur son dos, gagner est même synonyme de mauvais présage.

Très peu patiente, Tsunade possède un caractère agressif et un tempérament hystérique et capricieux. Son caractère a changé le jour où elle a perdu les deux êtres qui comptaient le plus pour elle, Dan et Nawaki. Sa peur phobique du sang et sa crainte du vieillissement sont ses seuls points faibles, c'est pourquoi elle utilise ses connaissances médicales pour conserver un visage très jeune. Elle a recours pour cela à "la création et au renouveau" (Sôzô Saisei), un sort de renaissance qui permet de régénérer ses organes en écourtant sa propre durée de vie. Sollicitée par Orochimaru pour guérir ses bras scellés par le troisième Hokage, elle décide de jouer double jeu avant de rejoindre définitivement le camp de Konoha aux côtés de Jiraiya.

Parce que son frère Nawaki ressemblait beaucoup à Naruto et qu'ils avaient tous deux le rêve de devenir Hokage, elle prend conscience de tout ce qu'elle peut apporter à Konoha et accepte de devenir Godaime, le cinquième Hokage. Bien qu'elle soit la première femme à obtenir ce titre, elle sait faire preuve de sérieux quand la situation l'exige et assume parfaitement son rôle. Elle prendra Sakura pour disciple dans la période Shippûden et lui léguera son art du ninjutsu médical. Le pacte qu'elle a passé avec la limace Katsuyu lui permet de l'invoquer en combat pour utiliser la technique du mucus acide (Zetsushi Nensan) contre le python d'Orochimaru.

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Orochimaru

Ennemi numéro un durant la majeure partie du manga, Orochimaru est un shinobi malveillant et ambitieux qui n'a désormais plus grand-chose d'humain. Son ambition sans limite le pousse à vouloir s'emparer de toutes les techniques passées, présentes et à venir, et à percer le mystère de l'immortalité. Il y parvient en faisant migrer son âme d'un corps à un autre avant que son enveloppe charnelle ne périsse, ce qui lui assure une existence illimitée dans le temps.

Après avoir apposé sa marque maudite sur Sasuke qu'il a choisi pour être le prochain réceptacle de son âme, il se fait passer pour le Kazekage et affronte Sandaime envers qui il éprouve un très fort ressentiment depuis qu'il lui a refusé le titre de quatrième Hokage. Orochimaru était pourtant le disciple de Sarutobi, mais il semble n'avoir jamais eu la moindre sympathie pour son maître et pour ses compagnons. Ayant été banni de Konoha pour avoir fait des expériences mortelles sur des humains, il a juré de provoquer la chute du village caché du feu.

Ses talents résident dans sa faculté à changer de corps et de visage en muant à la manière d'un serpent. Il a également une prédilection pour les techniques interdites, comme le sort d'immortalité et la réincarnation des âmes (Edotensei) qui lui permet de faire revenir à la vie les deux premiers Hokage. Après avoir subi l'emprisonnement des morts de Sandaime, il survit mais se retrouve dans l'impossibilité d'utiliser ses bras, et donc d'exécuter les signes incantatoires requis pour les techniques de ninjutsu. Dans la période Shippûden, il n'est pas directement lié à l'Akatsuki et se déplace de refuge en refuge à travers tout le pays pour ne pas être repéré, mais son ombre plane néanmoins au-dessus de la tête de Sasuke.

Orochimaru peut faire sortir de sa bouche l'épée de Kusanagi qui, d'après les légendes nippones, était l'un des trois symboles impériaux trouvés à l'intérieur du serpent géant Orochi no Yamata. Outre la poigne du serpent spectral (Sen'ei Jayu) et le triple rempart (Sanjû Rashômon), il est capable d'invoquer Manda, le python géant, avec qui il a établi un pacte de sang.

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