Vus dans le premier Paper Mario et repris ensuite dans Mario & Luigi Superstar Saga sur GBA, les badges jouent un rôle crucial dans la mesure où ce sont eux qui déterminent de quelles actions vous pouvez bénéficier en combat. La plupart sont bien cachés dans les niveaux et on en dénombre une bonne quarantaine au total. Ceux-ci se répartissent en plusieurs catégories, certains offrant notamment des bonus de soutien (comme un supplément de points en attaque, défense, vie, etc.), des malus sur les ennemis, un regain de HP ou de points d'action, et surtout de nouvelles techniques. Ces techniques consomment des points d'action et permettent par exemple d'attaquer plusieurs ennemis à la fois ou de décupler une attaque. Les possibilités son riches, et le tout est de savoir quels badges activer en priorité pour faire face à une situation donnée. Chaque badge requiert en effet un certain nombre de points pour fonctionner, et les points sont particulièrement limités. A chaque fois que Mario passe au niveau supérieur, il doit choisir s'il veut gagner des points de vie supplémentaires, des points d'action supplémentaires, ou des points de badge. Un vrai dilemme.
Concernant les autres commandes accessibles durant un combat, on peut citer la possibilité de prendre la pose pour obtenir les faveurs du public, de fuir, de changer de partenaire, d'utiliser un objet ou de se mettre en défense. La dernière commande cruciale demeure tout de même l'attaque spéciale. Celle-ci fonctionne à partir des étoiles obtenues et permet d'utiliser le pouvoir relatif à l'une des pierres d'étoiles acquises. On peut ainsi secouer tout l'écran pour mettre KO ses adversaires, tenter de regagner des points de vie et d'action ou même stopper le temps. Ce n'est qu'un aperçu des différents pouvoirs des étoiles, mais chaque utilisation implique la réussite d'une manip plus ou moins complexe à effectuer. Enfin, en éliminant ses adversaires, on peut aligner des symboles qui, s'ils correspondent, peuvent conduire au jackpot qui donne la possibilité de regagner la totalité de son statut.
